sequence alignment أمثلة على

• Sequence alignment is a fundamental research method for modern biology.
  تسلسل المحاذاة هو طريقة بحث اساسية عن البيولوجيا الحديثة.
• The sequence alignment and template structure are then used to produce a structural model of the target.
  ثم يتم استخدام محاذاة التسلسل وهيكل القالب لإنتاج نموذج هيكلي للهدف.
• Both fields had developed combinations of sequence alignment operations to facilitate the comparison of whole sequences.
  طور كلا الحقلين مجموعة من عمليات محاذاة التسلسل لتسهيل المقارنة بين التسلسلات الكاملة.
• Multiple sequence alignment is an extension of pairwise alignment to incorporate more than two sequences at a time.
  تعدد تسلسل المحاذاة هي امتداد لمحاذاة العشوائية لدمج أكثر من اثنين من سلاسل في وقت واحد.
• In almost all sequence alignment representations, sequences are written in rows arranged so that aligned residues appear in successive columns.
  في تقريبا كل تمثيلات محاذاة التسلسلات ، التسلسلات مكتوبة في صفوف مرتبة حيث تظهر بقايا المنحازة في أعمدة متعاقبة.
• The most common sequence alignment for protein is to look for similarity between different sequences in order to infer function or establish evolutionary relationships.
  سلسلة محاذاة البروتينالأكثر شيوعا هي للبحث عن التشابه بين مختلف السلاسل من أجل الاستدلال على وظيفة أو إقامة العلاقات التطورية.
• FASTA takes a given nucleotide or amino acid sequence and searches a corresponding sequence database by using local sequence alignment to find matches of similar database sequences.
  فاستا يأخذ سلسلة النكليوتيد أو الحمض الأميني المعينة ويبحث قاعدة بيانات السلسلة المقابلة باستخدام التراصف التسلسلي المحلي لإيجاد نظائر لسلاسل قاعدة بيانات مماثلة.
• Structural alignment is a valuable tool for the comparison of proteins with low sequence similarity, where evolutionary relationships between proteins cannot be easily detected by standard sequence alignment techniques.
  التراصف البنيوي يشكل أداة قيمة لمقارنة البروتينات ذات التشابه التسلسي الضئيل، حيث تكون العلاقات التطورية بين هذه البروتينات غير قابلة للكشف بسهولة عن طريق تقنيات التراصف التسلسلي المعيارية.
• Proteins that do not share a common ancestor are very unlikely to show statistically significant sequence similarity, making sequence alignment a powerful tool for identifying the members of protein families.
  البروتينات التي لا تمتلك أصلا مشتركا من المستبعد ان تظهر احصائيا تشابه في تسلسل أحماضهم الأمينية، و ذلك يجعل تقنية ترتيب التسلسل أداة قوية في التعرف على أعضاء العائلة البروتينية.
• However, multiple sequence alignment might reveal that helix-favoring amino acids occur at that position (and nearby positions) in 95% of homologous proteins spanning nearly a billion years of evolution.
  ومع ذلك، قد تكشف محاذاة تسلسل متعددة أن الأحماض الأمينية تفضل الحلزون تحدث في هذا الموقف (والمواقف القريبة) في 95٪ من البروتينات متماثلة التي تمتد ما يقرب من مليار سنة من التطور.
• The FASTA file format used as input for this software is now largely used by other sequence database search tools (such as BLAST) and sequence alignment programs (Clustal, T-Coffee, etc.).
  صيغة ملف فاستا المستخدمة كمدخل لهذه البرامج تستعمل الآن بشكل كبير من قبل أدوات بحث قاعدة بيانات بتسلسل آخر (مثل أداة بحث الاصطفاف المحلية الأساسية) وبرامج اصطفاف التسلسل (كلوستال، تي-كوفي ,الخ).
• Most progressive multiple sequence alignment methods additionally weight the sequences in the query set according to their relatedness, which reduces the likelihood of making a poor choice of initial sequences and thus improves alignment accuracy.
  إن معظم طرق تراصف السلاسل لمتعددة التقدمية تقوم بوضع أوزان في المجموعة المطلوبة من السلاسل تبعاً لمدى ترابطها، والذي يقلل من احتمالية أخذ الخيار غير الموفق للسلاسل الابتدائية وتطوير صحة ودقة التراصف.
• Machine learning has also been used for the problem of multiple sequence alignment which involves aligning many DNA or amino acid sequences in order to determine regions of similarity that could indicate a shared evolutionary history.
  كما تم استخدام تعلم الآلة لمشكلة تراصف السلسلة المتعدد والتي تنطوي على محاذاة العديد من تسلسل الحمض النووي أو الأحماض الأمينية من أجل تحديد مناطق التشابه التي يمكن أن تشير إلى تاريخ تطوري مشترك.
• Sequence alignment methods were first used by social scientists with the goal of identifying commonalities among sequence patterns (for example, common career trajectories and common life-course sequences), categorizing individuals with respect to the classes or “types” of sequences they exhibited.
  استُخدمت طرق المحاذاة التسلسلية لأول مرة من قبل علماء الاجتماع بهدف تحديد القواسم المشتركة بين أنماط التسلسل (على سبيل المثال ، المسارات الوظيفية المشتركة وتسلسل مسار الحياة المشترك)، وتصنيف الأفراد فيما يتعلق بفئات أو أنواع التسلسلات التي عرضها.
• Although producing accurate models remains a challenge when only distantly related template structures are available, it has been suggested that sequence alignment is the bottleneck in this process, as quite accurate models can be produced if a "perfect" sequence alignment is known.
  رغم صعوبة إنتاج نماذج دقيقة حين لا تتوفر سوى قوالب بنيوية ذات صلة بعيدة، فقد تمت الإشارة إلى أن التراصف التسلسلي هو عنق الزجاجة في هذه العملية، حيث يمكن إنتاج نماذج دقيقة للبروتينات إن عُرف تراصف تسلسل مثالي لها.
• Although producing accurate models remains a challenge when only distantly related template structures are available, it has been suggested that sequence alignment is the bottleneck in this process, as quite accurate models can be produced if a "perfect" sequence alignment is known.
  رغم صعوبة إنتاج نماذج دقيقة حين لا تتوفر سوى قوالب بنيوية ذات صلة بعيدة، فقد تمت الإشارة إلى أن التراصف التسلسلي هو عنق الزجاجة في هذه العملية، حيث يمكن إنتاج نماذج دقيقة للبروتينات إن عُرف تراصف تسلسل مثالي لها.
• If we can line up the two sequences using a sequence alignment algorithm such that the mutations required to transform a hypothetical ancestor sequence into both of the current sequences would be evolutionarily plausible, then we'd like to assign a high score to the comparison of the sequences.
  إذا تمكنا من ترتيب التسلسلتين باستخدام خوارزمية ترتيب تسلسل بحيث تكون الطفرات المطلوبة لتحويل تسلسل سلفي افتراضي إلى كل من المتواليات الحالية قابلة للتطبيق من الناحية التطورية ، فعندئذ نود تعيين درجة عالية لمقارنة السلاسل..